益生凝結芽孢桿菌研究與應用

章緒論1
節(jié)芽孢桿菌概述1
一、芽孢桿菌的簡介1
二、芽孢桿菌的種類1
第二節(jié)凝結芽孢桿菌概述4
一、凝結芽孢桿菌的相關研究4
二、凝結芽孢桿菌的結構4
三、凝結芽孢桿菌的特性6
四、凝結芽孢桿菌的作用7
參考文獻8
第二章凝結芽孢桿菌的篩選與鑒定12
節(jié)凝結芽孢桿菌的篩選12
一、篩選標準14
二、BC9951的篩選16
三、BC99和BC66的篩選20
第二節(jié)凝結芽孢桿菌的鑒定22
一、BC9951的形態(tài)學鑒定23
二、BC99和BC66的形態(tài)學鑒定28
第三節(jié)凝結芽孢桿菌的保藏30
參考文獻31
第三章凝結芽孢桿菌的高密度發(fā)酵工藝34
節(jié)凝結芽孢桿菌的退化預防、復壯和活化34
一、凝結芽孢桿菌的退化預防34
二、凝結芽孢桿菌的復壯35
三、凝結芽孢桿菌的菌株活化35
第二節(jié)凝結芽孢桿菌的發(fā)酵條件優(yōu)化36
一、種齡36
二、初始pH37
三、溫度38
四、轉速39
五、接種量40
第三節(jié)凝結芽孢桿菌的發(fā)酵培養(yǎng)基優(yōu)化41
一、碳源的篩選及濃度試驗41
二、氮源的篩選及濃度試驗42
三、無機鹽的篩選及濃度試驗43
四、發(fā)酵培養(yǎng)基配方的響應面優(yōu)化44
五、發(fā)酵過程優(yōu)化——糖的補加工藝49
參考文獻53
第四章凝結芽孢桿菌芽孢形成和萌發(fā)55
節(jié)凝結芽孢桿菌的芽孢形成55
一、凝結芽孢桿菌的芽孢化啟動55
二、凝結芽孢桿菌芽孢化啟動通路的調(diào)控機制58
三、凝結芽孢桿菌芽孢化啟動通路及相關調(diào)控的構建62
四、基于全基因組測序的凝結芽孢桿菌芽孢形成及調(diào)控分析63
五、凝結芽孢桿菌芽孢形成的影響因素64
第二節(jié)凝結芽孢桿菌的芽孢萌發(fā)75
一、芽孢萌發(fā)過程75
二、凝結芽孢桿菌芽孢萌發(fā)的影響因素76
參考文獻77
第五章凝結芽孢桿菌的環(huán)境生理學82
節(jié)凝結芽孢桿菌對酸脅迫的響應83
一、細菌的耐酸調(diào)控機制83
二、酸脅迫下凝結芽孢桿菌的生長與存活85
三、基于全基因組測序的凝結芽孢桿菌耐酸機制分析92
四、凝結芽孢桿菌對酸脅迫的響應機制93
第二節(jié)凝結芽孢桿菌對膽鹽脅迫的響應101
第三節(jié)凝結芽孢桿菌對溫度脅迫的響應102
第四節(jié)凝結芽孢桿菌對其他脅迫的響應105
一、凝結芽孢桿菌對氧脅迫的響應105
二、凝結芽孢桿菌對抗生素脅迫的響應105
三、凝結芽孢桿菌對水分脅迫的響應106
參考文獻107
第六章凝結芽孢桿菌的代謝產(chǎn)物112
節(jié)凝結芽孢桿菌與抑菌物質(zhì)112
一、細菌素類抑菌物質(zhì)112
二、有機酸類抑菌物質(zhì)114
三、凝結芽孢桿菌的抑菌特性115
四、凝結芽孢桿菌與有機酸120
五、凝結芽孢桿菌與細菌素122
第二節(jié)凝結芽孢桿菌與乳酸129
一、微生物發(fā)酵法合成乳酸129
二、凝結芽孢桿菌與乳酸130
第三節(jié)凝結芽孢桿菌與短鏈脂肪酸132
一、SCFA的生成132
二、凝結芽孢桿菌與SCFA133
第四節(jié)凝結芽孢桿菌與酶類133
一、凝結芽孢桿菌與β-半乳糖苷酶133
二、凝結芽孢桿菌與α-半乳糖苷酶134
三、凝結芽孢桿菌與其他水解酶類134
參考文獻135
第七章凝結芽孢桿菌的組學研究142
節(jié)凝結芽孢桿菌基因組學研究142
一、凝結芽孢桿菌P38基因組分析144
二、凝結芽孢桿菌Hammer（ATCC 7050;DSM1）基因組分析145
三、凝結芽孢桿菌36D1基因組分析145
四、凝結芽孢桿菌2-6基因組分析146
五、凝結芽孢桿菌CGMCC 9951基因組分析153
六、凝結芽孢桿菌MA-13基因組分析154
七、凝結芽孢桿菌LBSC(DSM 17654)基因組分析155
八、益生菌凝結芽孢桿菌HM-08基因組分析157
九、凝結芽孢桿菌HS243基因組分析158
十、凝結芽孢桿菌S-lac基因組分析167
十一、凝結芽孢桿菌ZB29基因組分析171
十二、凝結芽孢桿菌NL01基因組分析172
第二節(jié)凝結芽孢桿菌次級代謝挖掘與泛基因組分析172
一、ANI值和DDH值分析和基因組系統(tǒng)發(fā)育分析172
二、核心基因組和泛基因組分析173
三、次級代謝產(chǎn)物合成基因簇173
第三節(jié)凝結芽孢桿菌轉錄組學研究178
一、凝結芽孢桿菌溫度脅迫轉錄組學分析178
二、凝結芽孢桿菌CGMCC 9951芽孢形成轉錄組學分析178
三、乳酸鈉和乳酸鈣對凝結芽孢桿菌2-6轉錄調(diào)控分析184
四、凝結芽孢桿菌R11對鉛脅迫轉錄組分析189
第四節(jié)凝結芽孢桿菌蛋白質(zhì)組學研究191
一、凝結芽孢桿菌BCS13002產(chǎn)乳酸的蛋白組學分析191
二、凝結芽孢桿菌2-6蛋白組學分析195
參考文獻197
第八章凝結芽孢桿菌的生理功能及其作用機制202
節(jié)醫(yī)用凝結芽孢桿菌生理功能及其疾病防治機制202
一、調(diào)節(jié)微生態(tài)平衡202
二、增強腸道屏障203
三、調(diào)節(jié)宿主代謝203
四、增強免疫功能204
第二節(jié)飼用凝結芽孢桿菌生理功能及其作用機制204
一、促進動物消化吸收，提高動物生長性能204
二、優(yōu)化腸道微生物區(qū)系組成205
三、增強動物免疫功能206
第三節(jié)農(nóng)用凝結芽孢桿菌生理功能及其生物防治機制206
第四節(jié)具有優(yōu)良生理功能的凝結芽孢桿菌207
一、凝結芽孢桿菌TBC-169207
二、凝結芽孢桿菌ATCC 7050209
三、凝結芽孢桿菌IS-2(ATCC PAT-11748)209
四、凝結芽孢桿菌SCC-19210
五、凝結芽孢桿菌GanedenBC30(GBI-30)210
六、凝結芽孢桿菌CGMCC 9951211
七、凝結芽孢桿菌BC99213
八、凝結芽孢桿菌BC66215
參考文獻215
第九章凝結芽孢桿菌的應用222
節(jié)凝結芽孢桿菌與醫(yī)藥行業(yè)222
一、凝結芽孢桿菌與腸道健康224
二、凝結芽孢桿菌與衰老226
三、凝結芽孢桿菌與呼吸道疾病227
四、凝結芽孢桿菌與高血壓、高血脂228
五、凝結芽孢桿菌與皮膚疾病228
六、凝結芽孢桿菌與婦科疾病229
七、凝結芽孢桿菌與類風濕疾病229
第二節(jié)凝結芽孢桿菌與食品行業(yè)230
第三節(jié)凝結芽孢桿菌與養(yǎng)殖行業(yè)231
一、凝結芽孢桿菌與畜類行業(yè)231
二、凝結芽孢桿菌與禽類行業(yè)232
三、凝結芽孢桿菌與水產(chǎn)行業(yè)234
四、凝結芽孢桿菌在生物飼料中的應用235
第四節(jié)凝結芽孢桿菌與生物農(nóng)藥236
第五節(jié)凝結芽孢桿菌與發(fā)酵工業(yè)237
一、凝結芽孢桿菌生產(chǎn)酶制劑237
二、凝結芽孢桿菌生產(chǎn)有機酸238
三、凝結芽孢桿菌生產(chǎn)細菌素238
參考文獻238