細菌真菌耐藥監(jiān)測實用手冊

章總論1
節(jié)細菌真菌耐藥監(jiān)測的目標和方法1
一、監(jiān)測菌種的要求2
二、藥物敏感性試驗3
三、統(tǒng)計學軟件3
四、藥敏數(shù)據(jù)的收集4
第二節(jié)細菌真菌耐藥監(jiān)測材料4
一、藥敏培養(yǎng)基4
二、藥敏紙片4
三、機器法藥敏板卡4
第三節(jié)藥敏試驗結果判讀標準5
一、藥敏試驗結果判讀的折點標準5
二、抗菌藥物和細菌組合6
三、CLSI藥敏試驗結果判讀折點標準6
四、CLSI M100折點使用注意事項7
第四節(jié)質(zhì)量保證體系8
一、建立專家系統(tǒng)9
二、建立中心實驗室9
三、建立督查考核制度9
第二章革蘭陽性細菌和抗菌藥11
節(jié)葡萄球菌屬細菌11
一、流行病學11
二、耐藥機制12
三、葡萄球菌屬和抗菌藥組合12
第二節(jié)腸球菌屬細菌14
一、流行病學14
二、耐藥機制15
三、腸球菌屬和抗菌藥組合16
第三節(jié)肺炎鏈球菌和其他鏈球菌屬細菌18
一、流行病學18
二、耐藥機制18
三、鏈球菌屬和抗菌藥組合19
第三章革蘭陰性細菌和抗菌藥23
節(jié)腸桿菌目細菌23
一、流行病學23
二、耐藥機制24
三、腸桿菌目細菌和抗菌藥組合25
四、藥敏報告注意事項27
第二節(jié)銅綠假單胞菌28
一、流行病學28
二、耐藥機制29
三、銅綠假單胞菌和抗菌藥組合30
第三節(jié)不動桿菌屬細菌33
一、流行病學33
二、耐藥機制34
三、不動桿菌屬和抗菌藥組合34
第四節(jié)嗜麥芽窄食單胞菌36
一、流行病學36
二、耐藥機制37
三、嗜麥芽窄食單胞菌和抗菌藥組合37
第五節(jié)洋蔥伯克霍爾德菌38
一、流行病學38
二、耐藥機制39
三、洋蔥伯克霍爾德菌和抗菌藥組合39
第六節(jié)嗜血桿菌屬細菌40
一、流行病學40
二、耐藥機制41
三、流感嗜血桿菌和抗菌藥組合42
第七節(jié)卡他莫拉菌43
一、流行病學43
二、耐藥機制44
三、卡他莫拉菌和抗菌藥組合44
第八節(jié)其他非腸桿菌目細菌45
一、流行病學和耐藥機制45
二、其他非腸桿菌目細菌和抗菌藥組合46
第四章真菌和抗真菌藥47
節(jié)念珠菌屬47
一、流行病學47
二、耐藥機制47
三、抗真菌藥品種和藥敏試驗要求49
第二節(jié)絲狀真菌53
一、流行病學53
二、耐藥機制53
三、抗菌藥品種和藥敏試驗要求55
四、藥敏試驗推薦原則56
第五章藥敏試驗方法學59
節(jié)紙片擴散法59
一、定義59
二、原理59
三、適用范圍59
四、操作步驟59
第二節(jié)E試驗66
一、定義66
二、原理66
三、適用范圍66
四、操作步驟66
五、E試驗結果的讀取67
六、質(zhì)控67
七、在E試驗過程中的注意事項68
第三節(jié)肉湯微量稀釋法68
一、定義68
二、原理69
三、適用范圍69
四、操作步驟69
五、質(zhì)控72
六、自動化肉湯法藥敏系統(tǒng)73
第四節(jié)瓊脂稀釋法73
一、定義及原理73
二、操作步驟74
第五節(jié)酵母菌藥敏試驗76
一、紙片擴散法76
二、肉湯微量稀釋法80
第六節(jié)絲狀真菌藥敏試驗87
一、紙片擴散法和E試驗87
二、肉湯微量稀釋法89
第六章耐藥表型和分子生物學檢測101
節(jié)革蘭陽性菌耐藥表型檢測101
一、青霉素酶101
二、甲氧西林耐藥葡萄球菌的檢測101
三、萬古霉素中介和耐藥金黃色葡萄球菌的檢測102
四、高水平氨基糖苷類耐藥及萬古霉素耐藥腸球菌檢測103
五、誘導克林霉素耐藥檢測103
六、青霉素耐藥肺炎鏈球菌104
第二節(jié)革蘭陰性菌耐藥表型檢測——β內(nèi)酰胺酶105
一、超廣譜β內(nèi)酰胺酶105
二、AmpC酶檢測107
三、碳青霉烯酶的檢測108
第三節(jié)革蘭陽性菌耐藥基因分子生物學檢測113
一、甲氧西林耐藥葡萄球菌（MRS）耐藥基因的檢測113
二、萬古霉素耐藥腸球菌耐藥基因的檢測114
第四節(jié)革蘭陰性菌耐藥基因分子生物學檢測116
一、超廣譜β內(nèi)酰胺酶基因的檢測116
二、質(zhì)粒介導AmpC酶基因的檢測118
三、碳青霉烯酶基因的檢測119
四、質(zhì)粒介導喹諾酮類耐藥基因的檢測122
五、質(zhì)粒介導氨基糖苷類耐藥基因檢測123
第五節(jié)真菌耐藥基因分子生物學檢測124
一、檢測原理125
二、檢測步驟125第七章細菌耐藥監(jiān)測數(shù)據(jù)規(guī)范化128
節(jié)細菌耐藥監(jiān)測數(shù)據(jù)審核和預處理128
一、臨床分離株信息準確性審核128
二、實驗室藥敏結果轉(zhuǎn)錄至WHONET軟件的有效性審核131
三、WHONET數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)錄后的加工處理132
第二節(jié)細菌耐藥監(jiān)測數(shù)據(jù)分析136
一、從耐藥監(jiān)測數(shù)據(jù)文件快速建立實驗室配置文件136
二、“革蘭陰性菌”總數(shù)和“革蘭陽性菌”總數(shù)兩者相加后的數(shù)據(jù)與“所有細菌”的統(tǒng)計結果不符的原因和解決方案137
三、有些藥物在耐藥、中介和敏感區(qū)域均無數(shù)值，只在“%？”那一欄現(xiàn)出100，其原因和解決方案138
四、為何在MIC結果一欄出現(xiàn)紙片擴散法的結果？會對統(tǒng)計結果有何影響139
五、出現(xiàn)“所有標本”中統(tǒng)計的菌株數(shù)與所有的細菌數(shù)統(tǒng)計結果不一致時的解決方案140
六、多臺電腦上WHONET軟件的輸入格式需要重新設置一致嗎140
七、出現(xiàn)“Type mismatch（類型不匹配）”的原因和解決方案141
八、出現(xiàn)“Overflow（溢出）”的原因和解決方案142
九、出現(xiàn)“Couldnt update： currently locked”錯誤提示的原因和解決方案142
十、統(tǒng)計MIC50或MIC90時出現(xiàn)G MIC值（如G256）的原因和解決方案143
十一、怎么提取細菌耐藥性監(jiān)測數(shù)據(jù)中的部分數(shù)據(jù)做成子文件進行統(tǒng)計分析144
十二、將WHONET DOS版數(shù)據(jù)庫文件轉(zhuǎn)換為WHONET 5版本格式數(shù)據(jù)文件的設置方法144
第三節(jié)如何進行耐藥監(jiān)測總結145
一、統(tǒng)計耐藥監(jiān)測數(shù)據(jù)必須要做的預處理工作146
二、WHONET軟件主要功能簡介146
三、宏（Macros）的設置與應用150
第八章其他細菌和抗菌藥154
節(jié)厭氧菌154
一、流行病學154
二、耐藥機制154
第二節(jié)結核分枝桿菌164
一、流行病學164
二、耐藥機制165
三、抗菌藥品種和藥敏試驗要求166
四、推薦原則167
五、藥敏試驗方法167
六、分子生物學方法174
第三節(jié)非結核分枝桿菌179
一、流行病學179
二、耐藥機制180
三、抗菌藥品種和藥敏試驗要求180
四、推薦原則181
五、藥敏試驗方法182
第四節(jié)少見菌和特殊病原菌189
一、乏養(yǎng)球菌屬和顆粒鏈菌屬（即營養(yǎng)缺陷鏈球菌或營養(yǎng)變異鏈球菌）189
二、明串珠菌屬和片球菌屬190
三、氣球菌屬191
四、孿生球菌屬192
五、乳球菌屬193
六、微球菌屬194
七、棒桿菌屬（包括白喉棒桿菌及其他棒桿菌）194
八、豬紅斑丹毒絲菌196
九、產(chǎn)單核細胞李斯特菌197
十、乳桿菌屬198
十一、需氧芽胞桿菌屬（不包括炭疽芽胞桿菌）及相關菌屬199
十二、HACEK細菌群（包括凝聚桿菌屬、心桿菌屬、侵蝕艾肯菌、金氏桿菌屬）200
十三、氣單胞菌屬201
十四、弧菌屬（包括霍亂弧菌）203
十五、空腸彎曲菌和大腸彎曲菌204
十六、幽門螺桿菌205
十七、巴斯德菌屬206
十八、潛在生物恐怖病原菌（炭疽芽孢桿菌、鼠疫耶爾森菌、鼻疽伯克霍爾德菌、類鼻疽伯克霍爾德菌、土拉弗朗西斯菌和布魯氏菌）207
十九、黏滑羅氏菌210
二十、奴卡菌及其他需氧放線菌210
附錄臨床病例分析213
一、復雜性上尿路感染213
二、復雜性尿路感染215
三、皮膚軟組織感染217
四、社區(qū)獲得性化膿性腦膜炎（一）219
五、社區(qū)獲得性化膿性腦膜炎（二）221
六、感染性心內(nèi)膜炎（一）223
七、感染性心內(nèi)膜炎（二）225
八、深靜脈導管相關感染227
九、社區(qū)獲得性肺炎229
十、社區(qū)獲得性肝膿腫231