土壤微生物研究原理與方法

第1章 土壤微生物研究概述
1.1 土壤微生物學(xué)的研究對象
1.1.1 土壤微生物多樣性
1.1.2 土壤微生物過程
1.1.3 土壤微生物與環(huán)境的關(guān)系
1.2 土壤微生物學(xué)的發(fā)展簡史
1.2.1 微生物研究方法進(jìn)程
1.2.2 土壤微生物學(xué)的創(chuàng)立
1.2.3 土壤微生物分子生態(tài)學(xué)的發(fā)展
1.3 土壤微生物學(xué)的研究展望
1.3.1 土壤微生物的分離與純培養(yǎng)
1.3.2 土壤宏基因組學(xué)技術(shù)及應(yīng)用
1.3.3 土壤微生物多樣性與功能耦合
1.3.4 土壤微生物的應(yīng)用技術(shù)
第2章 實驗室的設(shè)置與設(shè)備
2.1 實驗室的設(shè)置與功能
2.1.1 通用實驗室
2.1.2 專用實驗室
2.1.3 現(xiàn)代實驗室
2.2 實驗室的儀器與器皿
2.2.1 主要儀器
2.2.2 玻璃器皿
2.2.3 其他器具
2.2.4 生物安全柜
2.3 常規(guī)操作與注意事項
2.3.1 滅菌
2.3.2洗滌
第3章 土壤微生物的計數(shù)與分析
3.1 土樣的采集與預(yù)處理
3.1.1 準(zhǔn)備工作
3.1.2 土樣采集與記錄
3.1.3 土樣運輸與儲存
3.1.4 預(yù)處理與預(yù)培養(yǎng)
3.2 土壤微生物的分離與計數(shù)
3.2.1 培養(yǎng)基
3.2.2 一般微生物的分離與計數(shù)
3.2.3 厭氧微生物的分離與計數(shù)
3.2.4 土壤微生物的純化與培養(yǎng)
3.3 土壤微生物區(qū)系的分析
3.3.1 主要類群微生物的分離與計數(shù)
3.3.2 主要功能微生物的測定
3.4 根際微生物的分析
3.4.1 根際微生物的分離
3.4.2 根際優(yōu)勢菌的分群
3.4.3 根瘤菌與病原菌的檢測
3.4.4 叢枝菌根真菌的分析
3.5 土壤微生物生物量的測定
3.5.1 氯仿熏蒸法
3.5.2 底物誘導(dǎo)呼吸法
3.5.3 腺苷三磷酸測定法
3.5.4 土壤麥角甾醇分析法
3.5.5 土壤幾丁質(zhì)分析法
第4章 土壤微生物的鑒定與保藏
4.1 土壤微生物的分類與鑒定
4.1.1 土壤微生物的分類
4.1.2 微生物的傳統(tǒng)鑒定方法
4.1.3 微生物自動化鑒定系統(tǒng)
4.2 菌種的選育與保藏
4.2.1 菌種的選育與改造
4.2.2 菌種的保藏與復(fù)壯
第5章 土壤微生物多樣性的分析
5.1 微生物的物種多樣性分析
5.1.1 改進(jìn)培養(yǎng)措施
5.1.2 新型培養(yǎng)技術(shù)
5.2 微生物的功能多樣性分析
5.2.1 BIOLOG碳素利用法
5.2.2 功能基因組學(xué)研究
5.3 微生物的結(jié)構(gòu)多樣性分析
5.3.1 醌指紋法
5.3.2 脂肪酸譜圖法
5.4 微生物的遺傳多樣性分析
5.4.1 基于雜交的分析方法
5.4.2 基于PCR的分析方法
第6章 土壤微生物過程的分析
6.1 土壤碳轉(zhuǎn)化作用
6.1.1 土壤呼吸作用
6.1.2 纖維素分解作用
6.1.3 土壤產(chǎn)甲烷作用
6.2 土壤氮轉(zhuǎn)化作用
6.2.1 土壤氮素礦化作用
6.2.2 土壤硝化作用
6.2.3 土壤反硝化作用
6.2.4 土壤固氮作用
6.3 土壤磷、鐵、硫轉(zhuǎn)化作用
6.3.1 土壤磷轉(zhuǎn)化作用
6.3.2 土壤鐵轉(zhuǎn)化作用
6.3.3 土壤硫轉(zhuǎn)化作用
6.4 土壤酶活性的測定
6.4.1 氧化還原酶活性
6.4.2 水解酶活性
6.4.3 轉(zhuǎn)移酶和裂解酶活性
第7章 土壤微生物的原位研究
7.1 土壤微生物的觀察
7.1.1 土壤微生物細(xì)胞的觀察
7.1.2 土壤微生物區(qū)系的原位觀測
7.1.3 根際微生物的觀測
7.2 模型生態(tài)系統(tǒng)的應(yīng)用
7.2.1 環(huán)流裝置
7.2.2 根際裝置
7.2.3 溫室氣體升高模擬裝置
7.2.4 土壤呼吸的田問原位測定裝置
7.3 穩(wěn)定性同位素技術(shù)的應(yīng)用
7.3.1 穩(wěn)定同位素示蹤技術(shù)
7.3.2 穩(wěn)定同位素核酸探針技術(shù)
第8章 土壤微生物的應(yīng)用技術(shù)
8.1 微生物肥料
8.1.1 固氮菌、解磷菌及解鉀菌
8.1.2 菌根真菌
8.1.3 根際促生菌
8.1.4 微生物有機(jī)肥
8.2 微生物農(nóng)藥
8.2.1 蘇云金桿菌
8.2.2 微生物除草劑與農(nóng)用抗生素
8.3 微生物修復(fù)
8.3.1 微生物對有機(jī)污染物的降解
8.3.2 微生物對重(類)金屬的轉(zhuǎn)化
8.3.3 微生物對生物污染的防治
8.3.4 微生物對復(fù)合污染的修復(fù)
第9章 實驗設(shè)計與數(shù)據(jù)分析處理
9.1 實驗設(shè)計
9.1.1 實驗設(shè)計的要素和原則
9.1.2 正交實驗設(shè)計
9.1.3 均勻?qū)嶒炘O(shè)計
9.1.4 其他實驗設(shè)計方法
9.2 數(shù)據(jù)分析處理
9.2.1 顯著性檢驗
9.2.2 方差分析
9.2.3 線性相關(guān)與一元線性回歸分析
9.2.4 多元分析處理中的主成分分析
9.2.5 聚類分析
9.2.6 典范對應(yīng)分析
附錄
一、培養(yǎng)基配方
二、常用酸堿溶液的配制
三、常用固態(tài)化合物溶液的配制
四、常用消毒劑的配制
五、常用酸堿指示劑的配制
六、常用分子生物學(xué)試劑的配制
七、常用引物列表
八、最大或然數(shù)法測數(shù)統(tǒng)計表
九、標(biāo)準(zhǔn)篩孔對照表
十、土壤中常見細(xì)菌、放線菌、真菌的檢索表
十一、國內(nèi)外微生物菌種保藏機(jī)構(gòu)網(wǎng)絡(luò)信息
十二、土壤系統(tǒng)分類檢索表
參考文獻(xiàn)